Θα πρέπει να δοθεί προσοχή στη χρήση του HEPES: ρυθμίστε το pH σύμφωνα με τη θερμοκρασία του πειράματος, ελέγξτε τη συγκέντρωση, αποφύγετε το φως και τη συσκευασία για να αποτρέψετε την αποσύνθεση, αποφύγετε υψηλές συγκεντρώσεις ή επαναλαμβανόμενους κύκλους κατάψυξης-απόψυξης, φιλτράρετε και αποστειρώστε μετά την παρασκευή, εκτελέστε αυστηρά ασηπτικές λειτουργίες και πραγματοποιήστε προκαταρκτική πειραματική επαλήθευση της συμβατότητας για να διασφαλίσετε την ακρίβεια του πειράματος.